mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCACACAAAGGCAACTTTTGT AGAGGTTGCCCTTGGTGAATTC TGAGCAGAGGTTGCCCTTGGTGAATTCGCTTTATTTATGTTGAATCACACAAAGGCAACTTTTGTTTG 1 2 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-154 7e-32 cfa-mir-377 4e-33 -27.8 .((((((((((((((.(((((((.(((((.........).)))))))).))).)))))))))))))). (-27.80)