mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTCCCACACCCAAGGCTTGCA CATGCCTTGAGTGTAGGACCGT GACTTGCTTTCTCTCCTCCATGCCTTGAGTGTAGGACCGTTGGCATCTTAATTACCCTCCCACACCCAAGGCTTGCAGAAGAGCGAGCCT 6 0 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-188 4e-34 ppy-mir-532 4e-46 -30.92 .....((((.((((.((.((.((((((.((((.(((..((.............))..))).)))).)))))).)).)).)))).)))).. (-30.92)