mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAGAAATTATCCTTGGTGTGT CATACAAGGACAATTTCTTTTT TACTTGAGGAGAAATTATCCTTGGTGTGTTCGCTTTATTTATGATGAATCATACAAGGACAATTTCTTTTTGAGTAT 1 2 5' arm Pan_troglodytes mirbase mir-154 2e-32 mml-mir-539 2e-38 -28.7 ((((..((((((((((.((((((.(((((((((.........).)))).)))))))))).))))))))))..)))). (-28.70)