mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAAACTGGCAATTACTTTTGC AAAAGTAATTGTGGTTTTTGCC GCAGGGAGGTATTAAGTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGTTTTTGCCATTAAAAGTAACGACAAAACTGGCAATTACTTTTGCACCAAACCTGATATT 2 0 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-548 2e-20 hsa-mir-548a-1 7e-45 -35.4 .((((...........(((((((((((((((((((.(.(((((.(.(((....))).).))))).).))))))))))))))))))).))))..... (-35.40)