mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAAACTGGCAATTACTTTTGC AAAAGTAACTGGGGTTTTTTGCC GTGATGTGTATTAGGTTTGTGCAAAAGTAACTGGGGTTTTTTGCCATTAAAAGTAATGACAAAACTGGCAATTACTTTTGCACCAAACTAATATAA 2 3 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-548 0.000000000000006 hsa-mir-548a-2 2e-42 -28.9 ......((((((((....((((((((((((.((.(((((..((.(((((....))))).)))))))..)).))))))))))))....)))))))). (-28.90)