mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAGTAATTGCGGATTTTGCC CAAAAACAGCAATTATTTTTGT AGATGGCTCCGAAGTTTGCATCCTCTTAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGCGGATTTTGCCATTAAAAGTAATGGCAAAAACAGCAATTATTTTTGTACTAGCCTAGTATCTTTTCTCCTTCTACCAAACTTTGTCCCTGAGACATCTCA 2 0 5' arm Pan_troglodytes mirbase mir-548 2e-37 ptr-mir-548i-5 7e-71 -57.81 (((((.((((((((((((.......((((((((((((((((((((((((.(.(((((((((((....))))))))))).).))))))))))))))))))))))))..................))))))))).....))).))))).. (-57.81)