mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAGTAATTGCGGATTTTGCC CAAAAATAACAATTATTTTTTT CAGATGGCTCCGAAGTTTGCATCCTATTAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGCGGATTTTGCCATTAAAAGTAATGGCAAAAATAACAATTATTTTTTTTACCAGCCTAGTATCTTTTCTCCTTTACCAAACTTTGTCCCTGAATCATCTC 3 0 5' arm Pan_troglodytes mirbase mir-548 7e-25 hsa-mir-548i-1 5e-47 -49.75 .(((((..(((((((((((.....(((((((((((((.(((((((((((..(.(((((((((((....))))))))))).)..)))))))))))..)))))))))))))...............))))))))).....))..))))). (-49.75)