mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAGTAATTGCGGATTTTGCC CAAAAACAGCAATTCTTTTTGT AGATGGCTCCGAAGTTTGCATCCTATTAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGCGGATTTTGCCATTAAAAGTAATGGCAAAAACAGCAATTCTTTTTGTAGCAGCCTAGTATCTTTTCTCCTTCTACCAAACTTTGTCCCTGAGACATCTCA 3 0 5' arm Pan_troglodytes mirbase mir-548 3e-36 ptr-mir-548i-5 2e-80 -54.1 (((((.((((((((((((.....((((((((((.((((((((.((((((.(.(((((((((((....))))))))))).).)))))).)))))))).))))))))))................))))))))).....))).))))).. (-54.10)