mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAACTATGGATGAGCTCT AGCTCATCCATAGTTGTCACT AGACATGCAACTCAAGAATATATTGAGAGCTCATCCATAGTTGTCACTGTCTCAGATCAGTGACAACTATGGATGAGCTCTTAATATATCCCAGG 0 0 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-549 1e-40 ppy-mir-549 5e-49 -53.2 .................((((((((((((((((((((((((((((((((........))))))))))))))))))))))))))))))))...... (-53.20)