mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACAGGTGACTGGTTAGACAA GTTTAACCTTTTGCCTGTTGG AACCATTCAAATATACCACAGTTTGTTTAACCTTTTGCCTGTTGGTTGAAGATGCCTTTCAACAGGTGACTGGTTAGACAAACTGTGGTATATAC 4 0 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-552 1e-40 hsa-mir-552 5e-49 -49.9 ..........((((((((((((((((((((((..(..((((((((..(.......)..))))))))..)..)))))))))))))))))))))).. (-49.90)