mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGCTGCTGTACCAAAAT TTTGGTATAGTAGCTCTAG TGTGTGTGTGTGTGTGTGGTTATTTTGGTATAGTAGCTCTAGACTCTATTATAGTTTCCTGAGCTGCTGTACCAAAATACCACAAATGGGCTG 1 0 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-558 1e-28 hsa-mir-558 1e-34 -42.1 .......((.(((.((((((.((((((((((((((((((..((..(((...)))..))..)))))))))))))))))))))))).))).)).. (-42.10)