mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAAGTAAATATGCACCAAAA TTGGTGCATATTTACTTTAGG CTCCAGTAACATCTTAAAGTAAATATGCACCAAAATTACTTTTGGTAAATATAGTTTTGGTGCATATTTACTTTAGGATGTTACTGGAGCTCCCA 0 0 5' arm Pan_troglodytes mirbase 100 hsa-mir-559 1e-46 -56.7 ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((.....))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))))...... (-56.70)