mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAGTAGCTGTACCATTTGC ATATGGTCAGTCTACTTTTA GTGAAATTGCTAGGTCATATGGTCAGTCTACTTTTAGAGTAATTGTGAAACTGTTTTTCAAAGTAGCTGTACCATTTGCACTCCCTGTGGCAAT 2 2 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-562 3e-35 hsa-mir-562 2e-48 -25 .....((((((((((((.((((((((.(((((((..(((.(((.(.....).))).))))))))))))).))))).)).))).....))))))) (-25.00)