mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATACTCCCTCCGTTCCATAAT TATGAAACGGAGGTAGTACAT GTTAAACTAATACTCCCTCCGTTCCATAATTCAATATTACATGTATCTAGACGTTTGAAAAAAATAGATACATTCATTTTTGGGCAAATTTGGGACAAGAATTATGAAACGGAGGTAGTACATATGTAC TTTCTTTTTTTTCGCTATAAAACTGTAGAATTATAATGCGAAACAACTTTGTTCAACATTGCACGACAGTTTCTGCTGAAAACGATGTCAAGTTCAGTTCCAATGAACTGTTAACATTTTTTATCTTGGTAGTCGCGGGGCCAAGGTTAAACTAATACTCCCTCCGTTCCATAATTCAATATTACATGTATCTAGACGTTTGAAAAAAATAGATACATTCATTTTTGGGCAAATTTGGGACAAGAATTATGAAACGGAGGTAGTACATATGTACTTCCTTTTATTACCAATGCCAATTAATGACCACATTTGATATGTAGAACGGTAATATATACACTGGTATTCGTTATTATGCTAATACTGTATGTTAATATCACAAAAGGATGTGATGGCAAGAACAGAATTCAATTTTGAGTGAATATATCTGGATTCCATTAGCAACTCTGCTAGCCAGCCGAAGAGTCAGACAACCTTTGCTAGATGCCCAAGAGAGATCTCCTGATCAAACCCAAGGTAGCAATCTGACACCACAATCAGCTTCGTTTCCTGGACATCAAACATCTGTGGCAATTTCATGCGAGTGCTAAGGACACGATCTGTAAAACTAATTCTTTTCAGACCATATAGCTCTGAGCTTGCAACATTCCCT 3 0 5' arm Brachypodium_distachyon mirnest MIR1122 0.00000000000003 osa-MIR818d 0.0004 -31.8 ..........((((.((((((((.((((((((....((..(((((((((....(((....))).)))))))))(((..(((....)))..)))))...)))))))).)))))))).))))......... (-31.8)