mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCATTTGGTATAAACCGCGATT TCGCGGTTTGTGCCAGATGACGATT ATATTAGGTTAATGCAAAAGTAATCGCGGTTTGTGCCAGATGACGATTTGAATTAATAAATTCATTTGGTATAAACCGCGATTATTTTTGCATCAAC 0 2 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-548 0.000005 hsa-mir-579 3e-50 -49.3 .......(((.((((((((((((((((((((((((((((((((..(((((......))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))) (-49.30)