mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGAATGATGAATCATTAGG TAATGATTCATCAGACTCAGAT TAAAATTTCCAATTGGAACCTAATGATTCATCAGACTCAGATATTTAAGTTAACAGTATTTGAGAATGATGAATCATTAGGTTCCAGTCAGAAATT 2 0 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-580 3e-41 hsa-mir-580 3e-47 -48.4 ...((((((..((((((((((((((((((((((..((((((((((.........))))))))))..))))))))))))))))))))))..)))))) (-48.40)