mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTGTGTTCTCTAGATCAGT GATCTAAAGAACACAAAGAAT TTATGTGAAGGTATTCTTGTGTTCTCTAGATCAGTGCTTTTAGGAAATTTGTGTGATCTAAAGAACACAAAGAATACCTACACAGAACCACCTGC 2 1 5' arm Pan_troglodytes mirbase mir-581 5e-34 hsa-mir-581 1e-46 -37.12 ...((((.(((((((((((((((((.(((((((.(((.............)))))))))).))))))).)))))))))).))))........... (-37.12)