mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCTAGCAACAGCGCTTACCT GGTAGGTGGTGCTGCTGTGCTCT AGATTGAGGAAGGGGCTGAGTGGTAGGTGGTGCTGCTGTGCTCTGATGAAGACCCATGTGGCTAGCAACAGCGCTTACCTTTTGTCTCTGGGTCC 2 2 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-621 4e-31 hsa-mir-621 1e-46 -33.9 .......(((((((((.(((.((((((((.((.(((((.(((...(((......)))..)))))))).)).))))))))))).))))))...))) (-33.90)