mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTAGTAAGAGTGGCAGTCGA GCTGACATATTTACTAGAGG ATAGCTGTTGTGTCACTTCCTCATGCTGACATATTTACTAGAGGGTAAAATTAATAACCTTCTAGTAAGAGTGGCAGTCGAAGGGAAGGGCTCA 3 1 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-628 2e-36 cfa-mir-628 2e-48 -35.8 ........((.(((.((((((..(((((.(((.(((((((((((((..........))))))))))))).))).))).))..))))))))).)) (-35.80)