mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACCAAGTTTATAGAAAAA TTTCTAAAAACTTGGTCAGAC TACTCTTGTCATAAGTCAAACTTCTTCATGTTTGACCAAGTTTATAGAAAAATCTACTAAGAATATCAAATGAGCGTGCTATGAAAATATATATAATAACAAATTTAATAAAACTAATTTGGACTTGTAGATTTTTCTAAAAACTTGGTCAGACTTGAAGAAGTTTGACTT CCACGCGTCCGAGATCTTCTACTTATTTATTTAGAGTCTTGGCTTTGTTTTTGTTCTTTTGCTTTCTTTCAGCTTATCCATATTTTGTCTTTTGTAACTTTCGCCTTCTGGGCGCTTCTTCAAATGAAAATAGCAGTTATACGTGCGGGTTCAAGGAATTTTATTTATTTATGTTAAGACAGTATCTAGATGAGTGTGTTTGAGAGGGAGTAGTAGTTATATGTGTATCTTGCAGTTTGGATGTTTTGGAGTTACGATAGAATTTACTTGTCCAGTGATGACATAAAGTTTATACCATATATGCCAACCCAACCCCATATTTGGTAAATGTTCATCCTACTCCTGTCATCCCTCTAAAATATAAATGCTCACAAAATGGCACTCATGTTAACCATATTTAATCATTCTGTTGATATAATTAGATTCTCTACGTTTTTCCTGTTGATTACCGGTGGGTGAAATGATATATCCGGGTGTATTAACTGTAGAATCTTCTTGTTTATTACTCCTTCCGTTCCTAAATATAAGAAGTCCTACTCTTGTCATAAGTCAAACTTCTTCATGTTTGACCAAGTTTATAGAAAAATCTACTAAGAATATCAAATGAGCGTGCTATGAAAATATATATAATAACAAATTTAATAAAACTAATTTGGACTTGTAGATTTTTCTAAAAACTTGGTCAGACTTGAAGAAGTTTGACTT 1 0 5' arm Brachypodium_distachyon mirnest 100 osa-MIR437 0.0000000006 -59.7 ............((((((((((((((((.((((((((((((((.(((((((((((((.(((....((((((....((..(((.(((.................))).)))..))..)))))).)))))))))))))))).)))))))))))))).)))))))))))))))) (-59.7)