mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTACTCCCTCCGTCCCATATT TATGGGACGGAGGGAGTACAA TGCTCCCTCCGTTTGTAAATAGTACTCCCTCCGTCCCATATTTAAGTGACTCAAATTTGCCCAAATATGGATGTATCTATTCCCAAAAAGCGTCTAATACATGTATGGGACGGAGGGAGTACAACATTTATGTTTGTCTTAA CCACGCGTCCGCGGACGCGTGGGGTACTATCTGCAGCCTGGGAAAGAACGTTGTTAGTTGTACGGTTTAGAAGACCACAGGTAAGATCTATTGATCAATTGTTTAAATTTTGCTGAAAGATTTTGGTCTTGTTTGTCCTGTATGGTTGAATTCATAAAGATTTTCCTCATTTGAGATCCTAAGTGAAAAGTAATGAAAATCTTTTATCTTAAATGCGCTCTGAGGGGCATCAACATGTCCTATTGATCACTTGTTTAAATTTGCTGAAAGATTTTGGTCTTGTTTGTCCAGTATGGATGAATTGATAAAGATTTCTTTTCATTCGTGATCCCAAGTGAAAAGTAATGAAAATCTTTATCTTAAGTGCGCTCTGAAGAGCATCAACCTGTTTGAGCACCTTTTCAGTAGCATAGTTTCCATCTTTAATGCATGCAGTCACAACTGCTCCCTCCGTTTGTAAATAGTACTCCCTCCGTCCCATATTTAAGTGACTCAAATTTGCCCAAATATGGATGTATCTATTCCCAAAAAGCGTCTAATACATGTATGGGACGGAGGGAGTACAACATTTATGTTTGTCTTAAGTCAAACTTCTCTAAGTTCGACCAATCTTTTAGACAAATATACCAAGACTTACGACACCAAATTAGTTTCATTTTATCCATAATGAAATATATATATTCATATTGTCTTTATTTGATATCGTAGATCTGTATATTTTTATATACCAAGTCAAACTTCAACTTCACTAAGTTTGACTTAGGATAAAGCTAAATGTACTACTACTACTACTATTGAGAAACGCTTGGAGTATAAGTTTATGTATGCTCAGTGACTACGTCTGGTGTGAAGTTTGGTTTAGGATACACTATATGTACTA 1 0 5' arm Brachypodium_distachyon mirnest MIR1122 6e-22 bdi-MIR437 0.0000000005 -42.4 .........((..(((((((.((((((((((((((((((((......(((.....(((........(((((....)))))......)))..)))........))))))))))))))))))))...)))))))..))...... (-42.4)