mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGAGGTTGGCATTGTTGTCT ACAACAGTGCCAACCTCACGGG ACTTAATGTGTGCCAAGATCTGTTCATTTATGATCTCACCGCGTCCTGTGAGGTTGGCATTGTTGTCTGGCATTGTCTGATATACAACAGTGCCAACCTCACGGGACTCAGTGAGGTGAAACTGAGGATTAGGAAGGTGTA 1 0 5' arm Pan_troglodytes mirbase 100 hsa-mir-1294 1e-69 -62.7 ........((..((..(((((..(((.((.(.(((((((.(.((((((((((((((((((((((((.((.((.....)).)).)))))))))))))))))))))))).).))))))).))).)))))))).....))..)) (-62.70)