mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGTAT ACATACTTCTTTATATGCCCATA TGGGAAACATACTTCTTTATATGCCCATATGGACCTGCTAAGCTATGGAATGTAAAGAAGTATGTATCTCA 2 1 3' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-1 2e-26 mml-mir-1-1 7e-35 -30 .((((.((((((((((((((((..((((((((.....)))...))))).)))))))))))))))).)))). (-30.00)