mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGGAGCTCACAGTCTATTGAG TTCCCACTAGATTGTGAGCTCCTGGA GGTCCTTGCCCTCAAGGAGCTCACAGTCTATTGAGTTACCTTTCTGATTTTCCCACTAGATTGTGAGCTCCTGGAGGGCAGGCACT 2 4 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-28 6e-33 ggo-mir-28 2e-41 -48.3 (((.(((((((((.((((((((((((((((.(((((((......)))))....)).)))))))))))))))).))))))))).))) (-48.30)