mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGCATTGTAGTTGCATTG ATGTTTCCACAGTGCATCA CTGCGGTGCATTGTAGTTGCATTGCATGTTCTGGTGGTACCCATGCAATGTTTCCACAGTGCATCACAG 3 0 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-33 7e-23 mml-mir-33a 3e-31 -33.4 (((.((((((((((.(..((((((((((....((.....))))))))))))..).)))))))))).))) (-33.40)