mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGCATGCTGTTGCATGCAC GCATGCTGTTGCATGCACGT GCGAGGCGGCGCCCGCGTGCATGCTGTTGCATGCACGTGTTGAGCGGTGCAGTGCCTCGGCAGTGCAGCCCGGAGCCGGCCCCTGGCACC 4 0 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-33 0.00000008 cfa-mir-33b 3e-19 -49.5 ((.(((((((.(((((((((((((....)))))))))))......((((((.(((....))).)))).)).)).))))...))).))... (-49.50)