mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCAGTGTCTTAGCTGGTTGT AATCAGCAAGTATACTGCCCTA GGCCAGCTGTGAGTGTTTCTTTGGCAGTGTCTTAGCTGGTTGTTGTGAGCAATAGTAAGGAAGCAATCAGCAAGTATACTGCCCTAGAAGTGCTGCACGTTGTGGGGCCC 1 2 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-34 4e-38 ggo-mir-34a 6e-58 -50.7 ((((.((((((((..(((((..(((((((((((.((((((((((....((....)).....))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))..))..)))). (-50.70)