mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACCCGTAGATCCGATCTTGTG CACAAGCTCGCTTCTATGGGTCTG CCCATTGGCATAAACCCGTAGATCCGATCTTGTGGTAAAGTGGACCGCACAAGCTCGCTTCTATGGGTCTGTGTCAGTGTG 4 2 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-10 8e-23 lla-mir-99a 2e-38 -38.7 ..((((((((((.(((((((((..(((.((((((((.......))))))..)).)))..))))))))).)))))))))).. (-38.70)