mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACAGTACTGTGATAACTGAA CAGTTATCACAGTGCTGATGCT TGCCCTGGCTCAGTTATCACAGTGCTGATGCTGTCCATTCTAAAGGTACAGTACTGTGATAACTGAAGGATGGCA 1 1 3' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-101 8e-29 lla-mir-101 3e-37 -36.2 .(((.....((((((((((((((((((.((((............)))))))))))))))))))))).....))). (-36.20)