mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACAGTACTGTGATAACTGAA CGGTTATCATGGTACCGATGCT ACTGTCCTTTTTCGGTTATCATGGTACCGATGCTGTATATCTGAAAGGTACAGTACTGTGATAACTGAAGAATGGTGGT 1 1 3' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-101 1e-27 mml-mir-101-2 1e-39 -31.4 ((..((.((((((((((((((((((((.(.((((............))))).)))))))))))))))))))).))..)) (-31.40)