mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAAATGCTCAGACTCCTGTGGT CACGGATGTTTGAGCATGTGCTA TGTGCATCGTGGTCAAATGCTCAGACTCCTGTGGTGGCTGCTTATGCACCACGGATGTTTGAGCATGTGCTATGGTGTCTA 4 0 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-105 2e-32 mml-mir-105-2 9e-41 -41.3 ...(((((((((.((.((((((((((..((((((((.(.......)))))))))..)))))))))).)))))))))))... (-41.30)