mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCATTTGCACCTGCACCTAC AGGTGCAGTGGCAGATGCAGG GAAGAATGGTGTGATTTTTGCTGCATTTGCACCTGCACCTACATCGAAGGAACGATAGAAGCACTGCACCTATTTCATCAATTATCGTCATGCAGGCTTCTTGATCCTCCTCCTAAGCTGCTTAGGTGCAGTGGCAGATGCAGGTGTATCACAGGAATTTTC TCAATCACAAGCACTCCAAGCACACATGCATACTACTTCCCTTGCTCTTCTTGATTTTCGTCGCTCCAGAAATTTGCAGGATCTGGTCTATCATCTATTTCCTCCGTCTAATATTAAGTGTTGAAATATTAAATGTATCTAAACGTTTTTTAGGTATAAATACATTCATATTTGAACAAATTTGAGACACTTGGTATGAGACGGAGGGAGTATATATGATACGGGAAGAATGGTGTGATTTTTGCTGCATTTGCACCTGCACCTACATCGAAGGAACGATAGAAGCACTGCACCTATTTCATCAATTATCGTCATGCAGGCTTCTTGATCCTCCTCCTAAGCTGCTTAGGTGCAGTGGCAGATGCAGGTGTATCACAGGAATTTTCGGAGACAGAAGTTAAGTTACTTCTATTGCTTCCTTTTCTTCGTTTTGTCATGTTTGAATCATAATTAACCGTGCAAATGATACGCTGATGGCTTTGTCTTGTTT 3 0 5' arm Brachypodium_distachyon mirnest 100 osa-MIR530 0.000002 -50.1 ...((((..((((((...((((((((((((..(((((((((......((((..(((((((((.(((((......................)))))))))))..)))....))))........)))))))))..))))))))).))).))))))...)))).. (-50.1)