mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTTTTGCGGTCTGGGCTTGC AAGCCCTTACCCCAAAAAGTA GGATCTTTTTGCGGTCTGGGCTTGCTGTTCCTCTCAACAGTAGTCAGGAAGCCCTTACCCCAAAAAGTATCT 4 0 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-129 3e-34 eca-mir-129a 2e-35 -29.4 (((((((((((.(((..((((((.(((..(..((....))..).))).))))))..))).))))))).)))) (-29.40)