mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTAGACTGAAGCTCCTTGAGG TCGAGGAGCTCACAGTCTAGTA TTTCCTGCCCTCGAGGAGCTCACAGTCTAGTATGTCTCATCCCCTACTAGACTGAAGCTCCTTGAGGACAGGGATGGTCATACTCACCT 1 1 3' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-28 3e-35 mml-mir-151 2e-45 -46.2 .((((((.((((((((((((..((((((((((.(........).)))))))))).)))))))))))).)))))).(((.......))). (-46.20)