mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACATTCATTGCTGTCGGTGGGT TCACTGAACAATGAATGCAAC CCTGTGCAGAGATTATTGTTTAAAAGGTCACAATCAACATTCATTGCTGTCGGTGGGTTGAACTGTGTGGACAAGCTCACTGAACAATGAATGCAACTGTGGCCCCGCTT 3 2 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-181 0.0000000001 lla-mir-181b 2e-55 -35.1 .....((..((((....))))....(((((((.....(((((((((...((((((((((...((....))...)))))))))).)))))))))....)))))))..)).. (-35.10)