mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACATTCAACCTGTCGGTGAGT CATCGACCGTTGAGTGGACC CGGAAAATTTGCCAAGGGTTTGGGGGAACATTCAACCTGTCGGTGAGTTTGGGCAGCTCAGGCAAACCATCGACCGTTGAGTGGACCCTGAGACCTGGAATTGCCATCCT 3 2 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-181 2e-30 ggo-mir-181c 2e-55 -45.16 .(((.......(((..(((((.((((..((((((((..(((((((.(((((...........)))))))))))).))))))))..)))).))))))))........))). (-45.16)