mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACATTCATTGTTGTCGGTGGGT CCACCGGGGGATGAATGTCAC TCCCCTCCCCTAGGCCACAGCCAAGGTCACAATCAACATTCATTGTTGTCGGTGGGTTGTGAGGACCGAGGCCAGACCCACCGGGGGATGAATGTCACTGTGGCTGGGCCAGACACGGCTTAAGGGGAATGGGGAC 2 2 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-181 0.0000000000005 mml-mir-181d 2e-73 -67.1 ((((((((((((((((...(((..(((((((....(((((((((.(..((((((((((....((.(....))).))))))))))).)))))))))...))))))).))).......))))).))))))..))))). (-67.10)