mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGCAATGGTAGAACTCACA GTTCTAGACTTGCCAACTA CACAGCTGCTTGCCTTCCCCCGTTTTTGGCAATGGTAGAACTCACACTGGTGAGGTAACAGGATCCGGTGGTTCTAGACTTGCCAACTATGGGGCGAGGACTCAGCCGGCAC 2 5 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-182 1e-41 hsa-mir-182 6e-55 -45.44 ....((((((..((((.((((((..(((((((.(.((((((...((((((..............))))))))))))..))))))))..)))))).))))....)).)))).. (-45.44)