mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGGCACTGGTAGAATTCACT TGAATTACCGAAGGGCCATAAA CAGAGCGTGACTCCTGTTCTGTGTATGGCACTGGTAGAATTCACTGTGAACAGTCTCAGTCAGTGAATTACCGAAGGGCCATAAACAGAGCAGAGACAGATCCACGA 2 4 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-183 1e-47 ggo-mir-183 9e-54 -41.5 .....((((..(((((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))))))))).....))..)))). (-41.50)