mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGTGTCTTGTGTTGCAGCCG GCTACAACATAGGACCCGGGC GGTTGGGCTCACCATGACACAGTGTGAGACCTCGGGCTACAACATAGGACCCGGGCGCTGCTCTGACCCCTCGTGTCTTGTGTTGCAGCCGGAGGGACGCAGGTCCGCA 4 0 3' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-187 9e-39 ggo-mir-187 1e-52 -44.2 ...(((.....))).(((...((((....((((.((((.(((((((((((.((((.((......).).)).)).))))))))))).)))).)))).))))..))).... (-44.20)