mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCAGCACAGAAATATTGGC CAATATTGGCTGTGCTGCTCCA AGCTTCCCTGGCTCTAGCAGCACAGAAATATTGGCACAGGGAAGCGAGTCTGCCAATATTGGCTGTGCTGCTCCAGGCAGGGTGGTG 2 1 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-16 2e-27 hsa-mir-195 3e-44 -46.44 .(((.(((((.((..((((((((((.((((((((((..............))))))))))..))))))))))..)).))))).))). (-46.44)