mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGGTAGTTTCATGTTGTTGG CAACAACATTAAACCACCCGAT GTGAATTAGGTAGTTTCATGTTGTTGGGCCTGGGTTTCTGAACACAACAACATTAAACCACCCGATTCAC 4 1 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-196 3e-28 mml-mir-196a-1 3e-34 -25.8 ((((((..(((.((((.((((((((((..(.........)..).))))))))).)))).)))..)))))) (-25.80)