mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATAAGACGAACAAAAGGTTTGT AAGCTTTTTGCTCGAATTATGT CCTCTCAGGGAAGCTTTTTGCTCGAATTATGTTTCTGATCCGAATATAAGACGAACAAAAGGTTTGTCTGAGGGCAG 4 0 3' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-208 8e-29 mml-mir-208b 2e-38 -31.3 .((((((((.((((((((((.(((..((((((((.......))))))))..))).)))))))))).))))))))... (-31.30)