mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGTCCAAACGCAATTCT AGTTGAGTCTGGACGTCCCG CCGCCCCGGGCCGCGGCTCCTGATTGTCCAAACGCAATTCTCGAGTCTATGGCCCCGGCCGAGAGTTGAGTCTGGACGTCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCTCGAGCGGG 3 1 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-219 8e-27 ggo-mir-219 2e-55 -54.5 ((((.(.((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).)))).........).)))). (-54.50)