mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTATCAGAATCTCCAGGGGTAC CCCCCAGGTGTGATTCTGATTTGC GGAGCTTATCAGAATCTCCAGGGGTACTTTATAATTTCAAAAAGTCCCCCAGGTGTGATTCTGATTTGCTTC 5 2 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-361 3e-22 mml-mir-361 2e-35 -32.3 (((((..(((((((((.((.((((.(((((..........))))).)))).))...)))))))))..))))) (-32.30)