mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGCTGCTGTACCAAAAT TTTGGTATAGTAGCTCTAGG GTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTTATTTTGGTATAGTAGCTCTAGGCTCTATTATAGTTTCCTGAGCTGCTGTACCAAAATACCACAAACAGGCTG 0 1 3' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-558 7e-27 hsa-mir-558 2e-32 -46.1 ........((.(((.((((((.((((((((((((((((((.(((..(((...)))...))))))))))))))))))))))))))).))).)).. (-46.10)