mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTACTCCCTCCGTACCATATT TATGAGACTGAGGGAGTATAT GTAAAAGTTTTTGCTGTTGTTGTACTCCCTCCGTACCATATTAAGTGACTTTCTATTAAGACGCTATTTAGGCATGAATAAATCCATATTTGGATAAATTTGATTCAATTAATATGAGACTGAGGGAGTATATGTAATGTAAACTGTTGTG AGATGCTTTTAGAGGCTTACTTTGTGCAAATTGATGGCACGCTTAATAAACTTTCTCATCTGAGGGAGTATGTTGATGATACTGAGGATTATATCAATATAATGTTGGATGACAAGCAAAATCAGCTTCTACAGATGGGGGTAATGCTCTCAACTGCGACAGTTGTCATTACTGCTGGAGTGGCCGTCGTTGGTCTTTTTGGGATGAACATTGGTATATCGCTTTACAATCCTGAAACCCCAGAAGAGAAACAAGCAGCAAATGTGATGTTTTGGGAAACCGCCTGTGGAACCATTGCCAGCTGCGCGATTCTGTACATAGTAGCCATGGTTTTGGGGAAAAGAAGTGGGCTACTGCAGTGATGGCGCAACCCATGGTAACTGCTCCCACAAAAGACTTGCCGGACAAAGTTCTGTAACAGACGGCAGTTTCTAGCCCGATTCTATATTGCTGCCTGAAAATGCATACCTGTTCCTATCCCAGGAAAATATTAAAAGGGAAAGATGTAAGTTCTTTTTATGTATGAAAATAGGTAGTTTTACTGGAAGACAATTGCTGCATAATGTGTTGCCAACAATACTGTCATAGCAACTCAAGTCTTTGCTATTACACTTGGATGCGCAATCGTTGATCCCACTTGGTGGAGATCGCTGGTACACTTGTTGTAAAAGTTTTTGCTGTTGTTGTACTCCCTCCGTACCATATTAAGTGACTTTCTATTAAGACGCTATTTAGGCATGAATAAATCCATATTTGGATAAATTTGATTCAATTAATATGAGACTGAGGGAGTATATGTAATGTAAACTGTTGTGAATGAGTTAAATAATTGACGACATAATGCC 3 0 5' arm Brachypodium_distachyon mirnest MIR1122 0.00000000000004 osa-MIR812h 0.0005 -37.2 .(((.(((((....(((((.(((((((((((.((..((((((((.(((.(((((....))).(((.....)))..((((..(((((....)))))..)))))).))).))))))))..)).)))))))))))..))))).))))).))).. (-37.2)