mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGAGGCAGCTCTCTCGGGAC CCTGGTCTCTGCTCCTCCTCA CAGTGCTGGGGTCTCAGGAGGCAGCTCTCTCGGGACGTCTCCACCATGGCCTGGTCTCTGCTCCTCCTCACCCTCCTCACTCAGGGCACAGGTGA 5 2 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-650 3e-29 hsa-mir-650 2e-39 -31.9 ..((((((((((...((((((.(((....(((((.(((.......))).))))).....))))))))).)))))..........)))))...... (-31.90)