mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTCACTCGGCTCGGCCCACTAC AAGTGCGCCTCGGGTGAGCATG GGTAAGTGCGCCTCGGGTGAGCATGCACTTAATGTGAGGTGTATGTCACTCGGCTCGGCCCACTACC 1 5 3' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-668 2e-19 mml-mir-668 1e-27 -33.4 ((((.(((.(((((((((((.(((((((((......)))))))))))))))))...))).))))))) (-33.40)