mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCGGTTCTCAGGGCTCCACC AGGAAGCCCTGGAGGGGCTGGAGG GCAGGTGAACTGGCAGGCCAGGAAGAGGAGGAAGCCCTGGAGGGGCTGGAGGTGATGGATGTTTTCCTCCGGTTCTCAGGGCTCCACCTCTTTCGGGCCGTAGAGCCAGGGCTGGTGC 1 3 3' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-671 4e-32 mml-mir-671 1e-62 -68.1 (((...(..(((((.((((.((((((((.(((.((((((..(((((((((((.(((....)))..)))))))))))))))))))).)))))))).)))).....)))))..)...))) (-68.10)